بررسی تنوع فنوتیپی و ژنتیکی باکتری Ralstonia solanacearum عامل پژمردگی باکتریایی سیب زمینی در استانهای کردستان و مرکزی [پایاننامه کارشناسی ارشد] (1389) / کریمی نورعینی ، منصوره، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه کریمی نورعینی ، منصوره، نویسنده عنوان : بررسی تنوع فنوتیپی و ژنتیکی باکتری Ralstonia solanacearum عامل پژمردگی باکتریایی سیب زمینی در استانهای کردستان و مرکزی [پایاننامه کارشناسی ارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: منصوره کریمی نورعینی استاد راهنما: بهروز حریقی استاد مشاور: بهمن بهرامنژاد ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1389 یادداشت موضوع: کشاورزی، عمومی و میان رشته ای
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما بهرامنژاد ، بهمن، استاد مشاور توصیفگرها فنوتیپ ، تنوع ژنتیکی ، باکتری ، رالستونیا سولاناسئاروم ، بیماری پژمردگی ، سیب زمینی ها ، کردستان (استان) ، مرکزی (استان) ، Phenotype, genetic diversity, bacteria, Ralstonia solanacearum, wilt disease, potatoes, Kurdistan (province), Markazi (province), چکیده : بیماری پژمردگی باکتریایی سیب زمینی از مشکلات اصلی در استانهای کردستان و مرکزی است. تحقیق حاضر به منظور شناسایی و تعیین تنوع جدایههای باکتری عامل بیماری و مقایسه آنها با جدایه مرجع صورت گرفت. از ساقه و غده سیب زمینی با علائم پژمردگی، از مناطق مختلف استان کردستان و مرکزی نمونهبرداری گردید. کلیه جدایهها همراه با نمونه استاندارد Ralstonia solanacearum از نظر خصوصیات بیوشیمیایی، فیزیولوژیکی مورد مقایسه قرار گرفتند. برای تشخیص دقیق جدایهها واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی توالی ژنهای hrp استفاده شد. تنوع ژنتیکی جدایه ها با استفاده از تکنیک rep-PCR مورد بررسی قرار گرفت. آزمون بیماری زایی در گلخانه با شرایط مساعد روی 7 رقم سیب زمینی انجام شد. بر اساس آزمونهای بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی استاندارد، 43 جدایه عامل بیماری R. solanacearum تشخیص داده شد. همه جدایهها متعلق به بیووار 2 بودند. تعداد 30 جدایه انتخاب گردید و در واکنش زنجیرهای پلیمراز مورد بررسی تکمیلی قرار گرفت. نتایج PCR با استفاده از آغازگرهای طراحی شده بر اساس توالی نوکلئوتیدی ژن hrp نشان داد که تعداد 7 نمونه یک باند مشابه 1486 جفت بازی تولید نمودند. تنوع ژنتیکی سویهها با استفاده از تکنیک rep-PCR با آغازگرهای BOX, REP و ERIC مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز دادهها با استفاده از برنامه NTSYS انجام گرفت. بر اساس نتایج بدست آمده جدایهها در سطح تشابه 51 درصد به 6 گروه تقسیم میشوند. نتایج این مطالعات نشان میدهد که پژمردگی باکتریایی سیب زمینی در استان کردستان و مرکزی گسترش زیادی دارد و یکی از بیماریهای خسارتزا میباشد. با استفاده از نتایج حاصل از دندروگرامها و نتایج آزمونهای بیوشیمیایی، میتوان نتیجه گرفت که تفاوتهای زیادی در سویه-های جمعآوری شده از مناطق مختلف استان وجود دارد که نشانگر وجود تنوع در باکتری R. solanacearum در این استانها بوده و میتواند مبین قابلیت تغییرپذیری این گونه باشد لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/62eefb0cc07d095c49b6848fc0697a30 لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15062 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت بررسی توان همستیزی سودوموناسهای فلورسنت جداسازی شده از مزارع شرق استان کردستان بر روی عامل مولد پوسیدگی نرم سیبزمینی [پایاننامه کارشناسی ارشد] (1392) / علیرضائی ، شادی، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه علیرضائی ، شادی، نویسنده عنوان : بررسی توان همستیزی سودوموناسهای فلورسنت جداسازی شده از مزارع شرق استان کردستان بر روی عامل مولد پوسیدگی نرم سیبزمینی [پایاننامه کارشناسی ارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: شادی علیرضائی استاد راهنما: بهروز حریقی ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1392 شناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما توصیفگرها پوسیدگی نرم ، پسودوموناس فلوئورسانس ، باکتری های آنتاگونیستی ، کردستان (استان) ، سیب زمینی ها ، کنترل زیستی ، soft rot, Pseudomonas fluorescens, antagonistic bacteria, Kurdistan (province), potatoes, biological control لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/4430bd5a4b4e3da25b3c4773a44b6825 لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15291 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت بررسی فعالیتهای آنتاگونیستی جدایههای Pseudomonas و Bacillus جدا شده از ریزوسفر نخود بر روی Fusarium oxysporum f. sp. ciceris، عامل پژمردگی فوزاریومی نخود در استان کردستان [پایاننامه کارشناسی ارشد] (1389) / کریمی ، کیوان، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه کریمی ، کیوان، نویسنده عنوان : بررسی فعالیتهای آنتاگونیستی جدایههای Pseudomonas و Bacillus جدا شده از ریزوسفر نخود بر روی Fusarium oxysporum f. sp. ciceris، عامل پژمردگی فوزاریومی نخود در استان کردستان [پایاننامه کارشناسی ارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: کیوان کریمی استاد راهنما: بهروز حریقی استاد راهنما: جهانشیر امینی استاد مشاور: بهمن بهرامنژاد ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1389 یادداشت موضوع: کشاورزی، عمومی و میان رشته ای
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما امینی ، جهانشیر، استاد مشاور بهرامنژاد ، بهمن، استاد مشاور توصیفگرها باسیلوس ، فوزاریوم اکسی اسپوریوم ، نخودهای ایرانی ، کردستان (استان) ، پسودوموناس ، فوزاریوم ، آنتاگونیسم ، بیماری گیاهی ، پژمردگی ، Bacillus, Fusarium oxysporium, Persian peas, Kurdistan (province), Pseudomonas, Fusarium, antagonism, plant disease, wilting, چکیده : نخود ایرانی (Cicer arietinum L.) یکی از محصولات مهم زراعی در استان کردستان میباشد. بیماری پژمردگی و زردی نخود ایرانی با عامل Fusarium oxysporum f. sp. ciceris یکی از محدود کنندههای کشت این محصول به شمار میرود. در نمونه برداری انجام شده از مزارع استان کردستان 11 جدایه مربوط به این بیمارگر شناسایی شد و براساس تست بیماریزایی جدایه F6 جهت انجام آزمایشات بعدی انتخاب گردید. در این بررسی نمونههایی از خاک ناحیه ریزوسفر گیاه سالم نخود جهت جداسازی رایزوباکترهای آنتاگونیست بصورت تصادفی از مزارع مختلف جمع آوری گردید. نمونههای خاک پس از تهیه سری رقتهای 3- 10 و4- 10 روی محیط آگار غذایی (NA) و Pseudomonas F Agar کشت داده شدند و 232 جدایه براساس رنگ، شکل و اندازه کلنی جدا گردیدند. جدایههای بدست آمده، جهت بررسی اثرات آنتاگونیستی با قارچ بیمارگر به روش کشت متقابل (Dual culture) بر روی محیط سیب زمینی- دکستروز- آگار (PDA) کشت داده شدند. 43 جدایه در تقابل با عامل بیمارگر پژمردگی و زردی نخود هاله بازدارندگی ایجاد کردند که براساس آزمون واکنش گرم، OF، و تولید رنگدانه فلوروسنت 6 جدایه متعلق به جنس Bacillus (B1,B6,B28,B40,B99, B108)و 6 جدایه (P11, P12, P66, P112) و (P9, P10) متعلق به Pseudomonas با خاصیت آنتاگونیستی بالا انتخاب و میزان بازدارندگی جدایهها از رشد بیمارگر نسبت به شاهد مقایسه گردید. براساس تستهای مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و فیریولوژیکی جدایههای باسیلوس، گونه Bacillus subtilis و جدایههای سودوموناس به ترتیب گونههایPseudomonas aeuroginosa و Pseudomonas putida تشخیص داده شدند. جدایهها با تولید آنتی بیوتیک و ترکیبات فرار توانستند از رشد میسلیومی قارچ بیمارگر جلوگیری کنند. همچنین جدایهها از نظر تولید متابولیتهایی همچون سیانید هیدروژن، سیدروفور، پروتئاز و اندول استیک اسید اثرات متفاوتی را از خود نشان دادند. در مطالعات گلخانهای، تاثیر جدایههای آنتاگونیست به دو روش آغشته سازی خاک و آغشته سازی بذر بر روی شدت بیماری، وقوع بیماری و فاکتورهای رشدی مورد ارزیابی قرار گرفت. در روش آغشته سازی خاک جدایههای P10, P12, B1, B6, B28, B99 و در روش آغشته سازی بذر جدایههای P12 و B28 به طور معنی داری نسبت به شاهد آلوده شدت بیماری را کاهش دادند اما در وقوع بیماری در همه تیمارها مشاهده شد و جدایهها نسبت به شاهد آلوده تاثیر معنیداری در کاهش وقوع بیماری از خود نشان ندادند. از نظر تاثیر جدایههای آنتاگونیست بر روی فاکتورهای رشدی، جدایههای B28، P12 و P112 به طور معنیداری نسبت به شاهد سالم ارتفاع، وزن تر و خشک گیاه را افزایش دادند. درکل با توجه به این نتایج پیشنهاد میشود که جدایههای باسیلوس و سودوموناس جهت کنترل زیستی بیماری پژمردگی زردی و پژمردگی فوزاریومی نخود موثر میباشند لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/2e28f909e0a8d854f5d02256cefada25 لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15068 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت بررسی مقاومت باکتریهای ریزوبیای همزیست با ریشه گیاهان لگومینوز به آرسنیک، در مناطق آلوده جنوب شرقی استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] (1390) / سعادتی ، رحیمه، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه سعادتی ، رحیمه، نویسنده عنوان : بررسی مقاومت باکتریهای ریزوبیای همزیست با ریشه گیاهان لگومینوز به آرسنیک، در مناطق آلوده جنوب شرقی استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: رحیمه سعادتی استاد راهنما: بهروز حریقی استاد راهنما: بهمن بهرامنژاد ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1390 یادداشت موضوع: علوم گیاهی
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما بهرامنژاد ، بهمن، استاد راهنما توصیفگرها کردستان (استان) ، نیامک داران ، همزیستی ، ریزوبیاسه ، زیست درمانی ، آرسنیک ، آلودگی خاک ، یونجه ، گره زایی ، فاکتورهای رشد ، نخودهای ایرانی ، مقاومت به فاکتورهای آسیب رسان ، Kurdistan (province), Niambdaran, symbiosis, rhizobiaceae, biotherapy, arsenic, soil pollution, alfalfa, nodulation, growth factors, Iranian chickpeas, resistance to damaging factors چکیده : آلودگی خاکها به آرسنیک، به یک نگرانی جهانی تبدیل شده است. اخیراً برهمکنش همزیستی Rhizobia-legume در گیاهان لگوم بهعنوان یک روش جایگزین جهت اصلاح زیستی خاک به همراه بهبود نیتروژن خاک مورد توجه قرار گرفته است. در این تحقیق مقاومت باکتریهای ریزوبیای همزیست با ریشه گیاهان تیره لگوم از قبیل یونجه و نخود به آرسنیک مورد مطالعه قرار گرفت. خصوصیات بیوشیمیایی 27 جدایه مورد بررسی قرار گرفت. جدایههای انتخابی جداسازی شده از یونجه، نخود، عدس، ماشک، یونجه زرد و خارشتر با استفاده از آغازگر مربوط به ژن 16S rDNA مورد مطالعه و شناسایی قرار گرفت. با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی ژن arsC، وجود ژن مقاومت به آرسنات در 18 جدایه تأیید گردید.در بررسی میزان تحملپذیری جدایهها به آرسنیک در محیط کشت مایع YEM حاوی غلظتهای مختلف آرسنات (100، 200، 250، 300، 350 و 400 میلیمولار)، جدایههای یونجه(AB1, AB3) ، سویه استاندارد (Sinorhizobium meliloti SM117)، جدایههای نخود (PA2, PC2)، جدایه عدس (L2)، جدایههای ماشک (VE1, VE2)، جدایه یونجه زرد (YA1) و جدایه خارشتر (Cth1) متحمل به غلظت 350 میلیمولار آرسنات و جدایههای (AB1, PA2, L2, VE2, YA1, Cth1) قادر به رشد در محدوده غلظتی بین 350 تا 400 میلیمولار آرسنات بودند.به منظور ارزیابی تأثیر آرسنیک بر توان گرهزایی جدایهها و میزان رشد گیاهان یونجه و نخود، آزمایشی بهصورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی با سه سطح (دو سطح تلقیح و یک سطح بدون تلقیح) و پنج سطح آرسنیک (صفر، 10، 50، 75 و 100 میلیگرم آرسنیک بر کیلوگرم خاک) و با سه تکرار در شرایط گلخانهای به مدت 8 هفته انجام شد. دادهها با روش تجزیه واریانس و با استفاده از نرمافزار SAS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.نتایج حاصل از آزمایش گلخانه نشان داد که تلقیح گیاه یونجه توسط سویههای AB1 و RM (سویه استاندارد) و تلقیح گیاه نخود توسط سویههای PC2 و PF2، بر وزن تر و خشک اندامهای هوایی و ریشه در غلظتهای مختلف آرسنیک تأثیر معنیداری داشته است. بهعلاوه از لحاظ تأثیر تلقیح بر میزان رشد گیاهان در غلظتهای مختلف آرسنیک، بین سویههای باکتری (AB1, RM) در یونجه و (PF2, PC2) در نخود با ضریب تبیین 99% تفاوت معنیداری وجود نداشت. بهطور متوسط در تیمارهای با تلقیح باکتری و بدون آرسنیک گیاهان یونجه و نخود به ترتیب، تعداد گرههای روی ریشه 5 تا 7 و 4 تا 5 در هر تکرار بود. در تیمارهای دارای آرسنیک و با تلقیح باکتری به ترتیب، 2 تا 5 و 2 تا 3 گره در هر تکرار مشاهده شد که نشان دهنده عدم تأثیر آرسنیک در میزان گرهزایی میباشد لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/8f68730f8cfde6db5ba164215f74ab44 لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15469 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت تعیین جایگاه تاکسونومیکی باکتری عامل بیماری سوختگی برگی سیاهتلو در استان کردستان [پایاننامه کارشناسی ارشد] (1391) / دلدوله ، منیره، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه دلدوله ، منیره، نویسنده عنوان : تعیین جایگاه تاکسونومیکی باکتری عامل بیماری سوختگی برگی سیاهتلو در استان کردستان [پایاننامه کارشناسی ارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: منیره دلدوله استاد راهنما: بهروز حریقی ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1391 یادداشت موضوع: کشاورزی، عمومی و میان رشته ای
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما توصیفگرها کنار ، سیاه تلو ، بلایت باکتریایی ، عنابیان ، گیاهان آرایه بندی ، آرایه شناسی ، کردستان (استان) ، اسید چرب ، Kanar, Siah Telo, Bacterial Blight, Jujubes, Sorting Plants, Taxonomy, Kurdistan (Province), Fatty Acid چکیده : سوختگی برگی باکتریایی درختچه سیاه تلو (Christ's thorn)، بیماری جدیدی است که تاکنون جایگاه دقیق تاکسونومیکی عامل بیماری مشخص نشده است. تحقیق حاضر به منظور تعیین جایگاه تاکسونومیکی باکتری عامل بیماری، از طریق بررسی ژن 16S rDNAو آنالیز پروفیل اسیدچرب باکتری عامل بیماری و مقایسه آن با جدایه های استاندارد صورت گرفت.در این بررسی از 15 جدایه که در طی بهار و تابستان سال های 86 و 87، از برگهای درختچه سیاه تلو با علائم سوختگی برگی جداسازی شده بود، استفاده گردید. در تحقیق حاضر ژن 16S rDNA باکتری عامل بیماری با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شد و توالی ژنی دو جدایه از 15 جدایه تعیین گردید. توالی این ژن در مقایسه با نمونه های استاندارد همولوژی بالای 97 درصد به جنس Sphingomonas را نشان داد. ترسیم درخت فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار MEGA4و به روش Neighbor-joining نشان داد که جدایه های مورد مطالعه در یک گروه فیلوژنتیکی به همراه گونه Sphingomonas melonis قرار میگیرند. آنالیز اسیدچرب یک جدایه نشان داد که نوع اسیدهای چرب موجود در این جدایه با اسیدهای چرب موجود در گونه Sphingomonas melonis به صورت کامل مطابقت دارد و درصد اسیدهای چرب موجود در جدایه مورد بررسی در این تحقیق با درصد اسیدهای چرب موجود در گونه Sphingomonas melonis شباهت بالایی دارد.نتایج به دست آمده از آنالیز فیلوژنتیکی ژن 16S rDNA، پروفیل اسیدچرب، خصوصیات مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی باکتری عامل سوختگی برگی سیاه تلو نشان داد که عامل بیماری مورد مطالعه در استان کردستان Sphingomonas melonis می باشد لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/f6b044f4e10076c5756e5eedaeb105f2 لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15372 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت تعیین خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی عامل بیماری آتشک گلابی در استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] (1391) / ملایی ، سیدنصرالله، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه ملایی ، سیدنصرالله، نویسنده عنوان : تعیین خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی عامل بیماری آتشک گلابی در استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: سیدنصرالله ملایی استاد راهنما: بهروز حریقی ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1391 یادداشت موضوع: علوم گیاهی
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، نویسنده توصیفگرها باکتری ها ، باکتریوزها ، اروینیا آمیلوورا ، تنوع ژنتیکی ، ژنوتیپ ها ، توالی نوکلئوتید ، پی.سی.آر ، گلابی ها ، فنوتیپ ها ، کارکردهای فیزیولوژیکی ، پیروس کومونیس ، Bacteria, bacterioses, Erwinia amylovera, genetic variation, genotypes, nucleotide sequence, PCR, pears, phenotypes, physiological functions, Pyrus communis چکیده : بیماری آتشک با عامل بیماری Erwinia amylovora یکی از بیماریهای درختان میوه انهدار در بسیاری از مناطق دنیا میباشد که خسارات زیادی را به این محصولات وارد میکند. این بیماری اولین-بار توسط شریفنبی و ذاکری از منطقه برغان کرج، بر روی گلابی مشاهده شد و پس از آن به تدریج به بسیاری از مناطق پرورش سیب و گلابی در پرورش سیب و گلابی در کشور گسترش یافت. این بیماری در سالهای اخیر خسارات هنگفتی به باغات میوه دانهدار در برخی مناطق کشور وارد کرده است و هم اکنون یکی از مهمترین بیماریهای درختان میوهدانهدار محسوب میشود. به علت اهمیت موضوع و از آنجا که بدون شناخت دقیق عامل بیماری مدیریت مبارزه با آن مشکل خواهد بود، لزوم بررسی و شناخت دقیق عامل بیماری ضروری میباشد. ابزار و وسایل پیشآگاهی، دستورالعملهای قرنطینهای و برنامههای اصلاح نژادی و مهندسی ژنتیک جهت انتخاب پایهها و کولتیوارهای مقاوم نیازمند داشتن اطلاعات جامعی در مورد تنوع ژنتیکی استرینها میباشد. با توجه به اینکه عامل بیماری آتشک در استان کردستان بطور دقیق مورد بررسی قرار نگرفته است، مطالعه حاضر به شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی عامل بیماری اختصاص یافت.در این تحقیق پس از نمونهبرداری از درختان گلابی مشکوک به بیماری در مناطق مختلف استان کردستان (شهرستانهای سنندج، بانه، مریوان، کامیاران، سروآباد و دیواندره)، جداسازی و خالص-سازی باکتریها انجام گرفت. 75 ایزوله لحاط ویژگیهای بیوشیمیایی، فیزیولوژیکی و تغذیهای مورد مقایسه قرار گرفتند. آزمونهای فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی نشان داد که استرینها درسطح تشابه 63% به سه گروه تقسیم شدند. برای شناسایی دقیقتر از آغازگرهای اختصاصی Amsb1 و Amsb2(آغازگرهای که ژن سنتزکننده آمیلوران را تکثیر میدهند) و همچنین pEA29 و pEB29 (آغازگرهای مرتبط با پلاسمید)، استفاده شد که تنها ایزولههای گروه فنوتیپی B، به ترتیب قطعات 1600 و 1000 بازی را تکثیر کردند. از آغازگرهای RecA1 و RecA2 نیز استفاده گردید که آنالیز تعیین توالی، تشابه بالایی با دو گونه E. amylovora و Pantoea agglomerans نشان داد. همچنین تعداد 52 ایزوله برای بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از تکنیک rep-PCR انتخاب و مورد ارزیابی قرار گرفتند. رسم دندروگرامهای حاصل از آنالیز پروفایل ژنتیکی شباهت زیادی بین گروهبندی فنوتیپی و ژنوتیپی را نشان داد لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/b8de664bb8104c291d3ef827111a7ecf لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15483 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت شناسایی و ارزیابی تنوع ژنتیکی عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هستهدار در استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] (1394) / احمدی ، سکینه، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه احمدی ، سکینه، نویسنده عنوان : شناسایی و ارزیابی تنوع ژنتیکی عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هستهدار در استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: سکینه احمدی استاد راهنما: بهروز حریقی استاد مشاور: جعفر عبدالهزاده ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1394 یادداشت موضوع: کشاورزی، عمومی و میان رشته ای
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما عبدالهزاده ، جعفر، استاد مشاور توصیفگرها شانکرها ، بیماری های گیاهی ، تنوع ژنتیکی ، زیست گوناگونی ، میوه های هسته دار ، کردستان (استان) ، فیلوژنی ، cankers, plant diseases, genetic diversity, biodiversity, stone fruits, Kurdistan (province), phylogeny چکیده : شانکر باکتریایی درختان میوه هستهدار بوسیله گونه Pseudomonas syringae پاتووارهای syringae وmorspronorum ایجاد میشود یکی از پاتووارهای مهم این باکتری (Pss) Pseudomonas syringae pv. syringae است. این پاتووار در شرایط اقلیمی مساعد، خسارت قابل توجهی را به باغات وارد میسازد. به منظور بررسی پراکنش سویههای عامل یا همراه بیماری در مناطق مختلف استان کردستان و نیز بررسی خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی، جدایههای باکتری در سالهای 91-92 از باغهای گیلاس، زردآلو، آلو، هلو و شلیل جمعآوری شدند. جداسازی و خالصسازی جدایههای باکتری، بر روی محیط کشت KingB انجام شد. خصوصیات فنوتیپی باکتریهای جدا شده براساس آزمونهای LOPAT و GATTa مورد مطالعه قرار گرفت. برای شناسایی دقیقتر20 جدایه انتخاب شده، از آغازگر اختصاصی ژن syrB استفاده گردید. در 12جدایه قطعهی مورد نظر به اندازه تقریبی 752 جفت باز تکثیر شد. جدایههای Pss براساس آنالیز خوشهای نتایج به دست آمده از rep-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ERIC وREP به ترتیب در سطح تشابه 60 و50 درصد و با ترکیب دو آغازگر در سطح تشابه 49 درصد به سه گروه اصلی تقسیم شذند. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی درون جدایههای Pss عامل بیماری شانکر درختان میوه هستهدار بود. بررسی تکمیلی به روش MLST با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنهایgyrB ، rpoD، gltA و gapA انجام گردید. در درخت فیلوژنی ترسیمی، 12 جدایه Pss در سه گروه مجزا قرار گرفتند و هشت جدایه به عنوان سودوموناس-های فلورسان همراه با بیماری، شامل گونههای P. fluorescens،P. orientalis ، P. putida و P. graminis در استان کردستان شناسایی شدند لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/859907383c3d6c271f3c119f27f6f06e لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15544 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت شناسایی، تعیین پراکنش و فراوانی ویروسهای مهم مو در استان کردستان [پایاننامه کارشناسی ارشد] (1388) / کمالی دشتارژنه ، مهدی، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه کمالی دشتارژنه ، مهدی، نویسنده عنوان : شناسایی، تعیین پراکنش و فراوانی ویروسهای مهم مو در استان کردستان [پایاننامه کارشناسی ارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: مهدی کمالی دشتارژنه استاد راهنما: بهروز حریقی استاد راهنما: علیرضا افشاریفر استاد مشاور: سامان بهرامی کمانگر استاد مشاور: علی نیازی ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1388 یادداشت موضوع: کشاورزی، عمومی و میان رشته ای
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهی ـ ویروسشناسیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما افشاریفر ، علیرضا، استاد راهنما بهرامی کمانگر ، سامان، استاد مشاور نیازی ، علی، استاد مشاور توصیفگرها ویروس های گیاهی ، ویتیس وینیفرا ، نپوویروس برگ بادبزنی مو ، کردستان (استان) ، شپشکان ، توباموویروس موزاییک توتون ، پی سی آر ، ایمونوگلوبولین ها ، گوجه فرنگی ، تاکستان ، Plant viruses, Vitis vinifera, nepovirus hair fan leaf, Kurdistan (province), aphids, tobacco mosaic tubamovirus, PCR, immunoglobulins, tomato, vineyard, چکیده : برای تعیین دامنه پراکنش 13 ویروس مهم مو تعداد 209 نمونه تصادفی از 9 شهرستان انگورخیز استان کردستان (بانه، بیجار، دهگلان، سروآباد، سقز، سنندج، قروه، کامیاران و مریوان) به همراه 17 نمونه دارای علائم از سطح باغات این استان و 56 نمونه از تاکهای وحشی از استانهای کردستان (منطقه اورامانات و پالنگان) و آذربایجان غربی (منطقه سردشت) جداسازی شد و با آزمون الایزا مورد ارزیابی قرار گرفت. نمونه برداری در اواخر تابستان و اوائل پائیز 1387 صورت گرفت.از ایمنوگلوبولینهای(IgG) ساخت شرکت بایوربای سوئیس (Bioreba, Reinach, Switzerland) جهت ردیابی ویروس موزائیک آرابیس ArMV، ویروس مخطط مو GFkV، ویروس برگ بادبزنی موGFLV ، ویروسهای همراه با پیچیدگی برگ مو شماره های 1، 2، 3 و 6 (GLRaV-1 ، GLRaV-2، GLRaV-3، GLRaV-6)، ویروس ای انگور GVA ،جدایههای گیلاس و انگور ویروس لکه حلقوی تمشک RpRSV-ch و RpRSV-g، جدایه سیب ویروس لکه حلقوی گوجه فرنگی ToRSV-ch (Tomato ringspot virus-chickadee strain)، ویروس لکه حلقوی توتون TRSV و ویروس لکه حلقوی پنهان توت فرنگیSLRSV، استفاده گردید.پس از انجام آزمون الایزا، آلودگی به ویروسهای ردیابی شده به شرح زیر مشاهده گردید: ToRSV-ch (60/29%)، SLRSV (59/33%)، RpRSV-g (55/50%)، TRSV (52/63%)، GVA (43/06%)، ArMV (38/79%)، GLRaV-1 (33/97%)، GFkV (24/88%)، GFLV (22/97%)، GLRaV-2 (10/20%)، GLRaV-3 (19/14%)، GLRaV-6 (13/40%) و RpRSV-ch (12/44%).در مورد تاکهای وحشی نیز وجود تمامی ویروسهای ردیابی شده در غرب (استان کردستان) و شمال غرب (استان آذربایجان غربی) کشور مشاهده شد. نتایج آزمون الایزا، آلودگی ویروسها را در تاکهای وحشی با یک همسویی کلی با تاکهای اهلی بصورت زیر مشخص می کند: ToRSV-ch (62/50%)، GVA (53/57%)، GFkV (33/92%)، TRSV (28/57%)، ArMV (26/78%) ، GLRaV-1 (21/42%)، SLRSV (19/46%)، GLRaV-2 (17/85%)، RpRSV-g (16/07%)، GLRaV-3 (14/28%)، RpRSV-ch (12/50%)، GLRaV-6 (10/71%) و GFLV (5/35%). همچنین از واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروسهای همراه با پیچیدگی برگ مو شماره 1 و ویروس ای مو جهت تعیین مجدد آلودگی استفاده شد. در نمونههای آلوده قطعه مورد نظر تکثیر شد. این آزمون در مورد 12 تاک وحشی رشد یافته در گلخانه استفاده گردید و آر.ان.ای کل به روش سیلیکا استخراج شد. موارد تأئید شده در مورد GVA، 7 عدد و در مورد GLRaV-1، 5 عدد بود.لازم به ذکر است وجود ویروسهای مهم مو بهجز ArMV وGFLV، برای اولین بار در استان کردستان مشخص گردید و وجود ویروسهای همراه با پیچیدگی برگ مو شماره 6 (GLRaV-6) و ویروس لکه حلقوی پنهان تمشک (SLRSV) برای اولین بار از تاکستانهای کشور گزارش گردیده است لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/f83b54fc3d2ece9ba611261af9883cd8 لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15047 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت مطالعه مقایسهای خصوصیات فنوتیپی و مولکولی باکتری مولد پوسیدگی نرم در استانهای کردستان و آذربایجان غربی [پایاننامه کارشناسیارشد] (1390) / حنانی ، صغری، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه حنانی ، صغری، نویسنده عنوان : مطالعه مقایسهای خصوصیات فنوتیپی و مولکولی باکتری مولد پوسیدگی نرم در استانهای کردستان و آذربایجان غربی [پایاننامه کارشناسیارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: صغری حنانی استاد راهنما: بهروز حریقی ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1390 یادداشت موضوع: علوم گیاهی
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما توصیفگرها فنوتیپ ، بررسی تطبیقی ، باکتری ، کردستان (استان) ، آذربایجان غربی (استان) ، آرایه شناسی ، دی.ان.آ ، الکتروفورز ، پوسیدگی نرم ، پکتوباکتریوم ، Phenotype, comparative study, bacteria, Kurdistan (province), West Azerbaijan (province), array, DNA, electrophoresis, soft rot, Pectobacterium چکیده : باکتریهای Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum، Pectobacterium atrosepticumو Dickeya chrysanthemi عوامل بیماری پوسیدگی نرم و ساق سیاه در بسیاری از محصولات مهم تجاری در طول فصل رشد، حمل و نقل و انبار هستند. این باکتریها بیمارگرهای فرصت طلب هستند که تمایل به ایجاد بیماری در مواقعی که مقاومت گیاه میزبان شکسته شده باشد را دارند. در این تحقیق 109 جدایه از غده و ساقهی گیاهان سیبزمینی، گوجهفرنگی، هویج و چغندرقند دارای علائم بیماری از مناطق مختلف استان کردستان و آذربایجان غربی جمعآوری گردید. خصوصیات فنوتیپی، بیوشیمیایی و انگشت-نگاری DNA در مورد همهی جدایهها مورد مطالعه قرار گرفت. مطابق خصوصیات افتراقی فنوتیپی جدایهها Pectobacterium، Dickeya و جنسهای حدواسط شناسایی شدند. بر اساس آنالیزهای نتایج خصوصیات بیوشیمیایی و فنوتیپی جدایهها به چهار گروه تقسیم شدند. 31 جدایه برای مطالعه تنوع ژنتیکی بر اساس توالیهای تکرار شونده در rep-PCR انتخاب شدند. برای انگشتنگاری ژنتیکی از آغازگرهای REP، ERIC و BOX استفاده شد. الگوهای بهدست آمده از rep-PCR بر اساس ضریب دایس تجزیه شدند و دندروگرامها با استفاده از نرم افزار NTSYS ver 02/2 و روش UPGMA رسم شدند. آغازگرهای REP، ERIC و BOX به ترتیب هفت، شش و پنج گروه را تشخیص دادند. انگشت-نگاری انجام شده توسط REP-PCR توانایی جدا کردن جدایهها را حتی در سطح زیرگونه دارد. نتایج آزمونهای فنوتیپی و ژنتیکی انجام شده، تنوع بالایی را میان جدایهها نشان داد و میان اثر انگشت ژنتیکی جدایهها با منطقه نمونهبرداری آنها ارتباط خاصی دیده نشد لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/5695e3da1fe9d8b532feeed73359cb8a لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15486 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت مقایسه فنوتیپی، بیوشیمیائی و مولکولی جدایههای باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae عامل بیماری سوختگی باکتریائی ساقه یونجه در استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] (1389) / حامدان ، الناز، نویسنده
نوع مدرک: برنامهها و فایلهای کامپیوتری سرشناسه حامدان ، الناز، نویسنده عنوان : مقایسه فنوتیپی، بیوشیمیائی و مولکولی جدایههای باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae عامل بیماری سوختگی باکتریائی ساقه یونجه در استان کردستان [پایاننامه کارشناسیارشد] تکرار نام مولف : پدیدآور: الناز حامدان استاد راهنما: بهروز حریقی ناشر: سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی سال نشر : 1389 یادداشت موضوع: علوم گیاهی
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماریشناسی گیاهیشناسه افزوده : حریقی ، بهروز، استاد راهنما توصیفگرها کردستان (استان) ، بررسی تطبیقی ، پسودوموناس سیرنژائه ، سوختگی (بیماری گیاهی) ، یونجه ، ژنتیک مولکولی ، فیزیولوژی گیاهی ، تنوع ژنتیکی ، خواص زیستی ، بلایت باکتریایی ، Kurdistan (province), comparative review, Pseudomonas syringae, blight (plant disease), alfalfa, molecular genetics, plant physiology, genetic diversity, biological properties, bacterial blight, چکیده : باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae عامل بیماریهای متعددی در بیش از 180 گونه گیاهی متعلق به جنسهای مختلف است. در سالهای اخیر بیماری سوختگی باکتریائی یونجه در مناطق مختلف استان کردستان گسترش یافته است. خصوصیات فیزیولوژیکی و بیوشیمیائی 64 جدایه مورد بررسی قرار گرفت. خصوصیات بیش از 80% جدایههای مورد مطالعه مشابهPseudomonas syringae pv. syringae LOPAT group 1a و کمتر از 5% جدایهها مشابه LOPAT group 1b تشخیص داده شدند. بررسی برخی جدایههای انتخابی با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن syrP نشاندهنده وجود این ژن بود. تنوع ژنتیکی جدایهها به همراه جدایه استاندارد با روش rep-PCR با استفاده از آغازگرهای ERIC ، REP و BOX مورد ارزیابی قرار گرفت. بعد از الکتروفورز محصول PCR، تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرم افزار NTSYS-pc ver 2/02 و روش UPGMA انجام شد. آنالیز خوشهای نتایج بهدست آمده نشان داد که جدایههای مورد مطالعه با استفاده از آغازگرهای BOX، REP و ERIC به چهار، شش و هفت گروه تقسیم میشوند. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی جدایههای Pss عامل بیماری سوختگی یونجه است. بهمنظور مقایسه میزان مقاومت سه ژنوتیپ یونجه قرهیونجه، قهاوند و مهاجران در مقابل باکتری عامل بیماری سوختگی باکتریائی یونجه (Pseudomonas syringae pv. syringae) آزمایشی بهصورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با دو فاکتور ارقام یونجه و جدایههای باکتری (در شش سطح) و با سه تکرار در سال زراعی 89-1388 در گلخانه دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان اجرا شد. برای هر تکرار یک گلدان حاوی چهار گیاه در مرحله 8-6 برگچهای در نظر گرفته و بوتهها به روش اسپریپاشی مایهزنی گردید. اسپریپاشی با آب مقطر سترون بهعنوان تیمار شاهد استفاده شد. گیاهان مایهزنی شده به مدت دو روز در زیر کیسه پلاستیک و در شرایط رطوبت بالا نگهداری شدند. علائم بیماری تا شش هفته پس از تلقیح، بهصورت روزانه مشاهده و ثبت گردید. شدت علائم بیماری برحسب درصد سطح برگ آلوده محاسبه شد. دادهها با روش تجزیه واریانس و با استفاده از برنامه SAS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت و مقایسه میانگین با آزمون LSD در سطح احتمال کمتر از 1% انجام شد. نتایج نشان داد که بین ارقام یونجه از نظر مقاومت به عامل بیماری اختلاف معنیداری وجود دارد. بهعلاوه از نظر بیماریزائی بین جدایههای مختلف باکتری تفاوت معنیداری مشاهده گردید. بهطور کلی میتوان نتیجهگیری نمود که مهاجران مقاومترین و قرهیونجه حساسترین ارقام مورد بررسی بودند لینک فایل دیجیتالی : https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/115ad73230fad3d3f3659ab009f4d4cf لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15082 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت