مطالعه مقایسهای خصوصیات فنوتیپی و مولکولی باکتری مولد پوسیدگی نرم در استانهای کردستان و آذربایجان غربی [پایاننامه کارشناسیارشد] (1390) / حنانی ، صغری، نویسنده
باکتریهای Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum، Pectobacterium atrosepticumو Dickeya chrysanthemi عوامل بیماری پوسیدگی نرم و ساق سیاه در بسیاری از محصولات مهم تجاری در طول فصل رشد، حمل و نقل و انبار هستند. این باکتریها بیمارگرهای فرصت طلب هستند که تمایل به ایجاد بیماری در مواقعی که مقاومت گیاه میزبان شکسته شده باشد را دارند. در این تحقیق 109 جدایه از غده و ساقهی گیاهان سیبزمینی، گوجهفرنگی، هویج و چغندرقند دارای علائم بیماری از مناطق مختلف استان کردستان و آذربایجان غربی جمعآوری گردید. خصوصیات فنوتیپی، بیوشیمیایی و انگشت-نگاری DNA در مورد همهی جدایهها مورد مطالعه قرار گرفت. مطابق خصوصیات افتراقی فنوتیپی جدایهها Pectobacterium، Dickeya و جنسهای حدواسط شناسایی شدند. بر اساس آنالیزهای نتایج خصوصیات بیوشیمیایی و فنوتیپی جدایهها به چهار گروه تقسیم شدند. 31 جدایه برای مطالعه تنوع ژنتیکی بر اساس توالیهای تکرار شونده در rep-PCR انتخاب شدند. برای انگشتنگاری ژنتیکی از آغازگرهای REP، ERIC و BOX استفاده شد. الگوهای بهدست آمده از rep-PCR بر اساس ضریب دایس تجزیه شدند و دندروگرامها با استفاده از نرم افزار NTSYS ver 02/2 و روش UPGMA رسم شدند. آغازگرهای REP، ERIC و BOX به ترتیب هفت، شش و پنج گروه را تشخیص دادند. انگشت-نگاری انجام شده توسط REP-PCR توانایی جدا کردن جدایهها را حتی در سطح زیرگونه دارد. نتایج آزمونهای فنوتیپی و ژنتیکی انجام شده، تنوع بالایی را میان جدایهها نشان داد و میان اثر انگشت ژنتیکی جدایهها با منطقه نمونهبرداری آنها ارتباط خاصی دیده نشد