| نوع مدرک: | برنامه‌ها و فایلهای کامپیوتری |
| سرشناسه | محمدی ، کژال، نویسنده |
| عنوان : | ردیابی برخی ویروس‌های مهم در جالیزکاری‌های استان کردستان با روش RT-PCR [پایان‌نامه کارشناسی ارشد] |
| تکرار نام مولف : | پدیدآور: کژال محمدی استاد راهنما: محمد حاجی‌زاده استاد مشاور: داود کولیوند |
| ناشر: | سنندج [ایران] : دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی |
| سال نشر : | 1393 |
| یادداشت | موضوع: ویروس‌شناسی
رشته: مهندسی کشاورزی - بیماری‌شناسی گیاهی ـ ویروس‌شناسی |
| شناسه افزوده : | حاجی‌زاده ، محمد، استاد راهنما کولیوند ، داود، استاد مشاور |
| توصیفگرها | ویروس ، کردستان (استان) ، نیکوتیانا تاباکوم ، کوکوربیتا پپو ، کوکومیس ساتیووس ، کنوپودیوم کینوآ ، خیارها ، پوتی ویروس موزاییک زرد کدو ، Virus, Kurdistan (Province), Nicotiana Tabacum, Cucurbita Pepo, Cucumis Sativus, Cenopodium Quinoa, Cucumbers, Pumpkin Yellow Mosaic Potyvirus |
| چکیده : | در پژوهش حاضر به منظور ردیابی ویروس‌های موزائیک خیار (CMV)، موزائیک زرد کدو (ZYMV) و موزائیک پیسک سبز خیار (CGMMV)از مزارع جالیز استان کردستان طی بهار، تابستان و پاییز سالهای 1392، 1393 تعداد 81 نمونه برگی بادمجان، خیار، فلفل، کدو، گوجه-فرنگی و لوبیاسبز مشکوک به آلودگی جمع‌آوری شد.در مایه‌زنی مکانیکی، عصاره برگ نمونه‌های مشکوک به آلودگی با این سه ویروس روی گیاهان محک سلمه‌تره (Chenopodium quinoa)، خیار (Cucumis sativus)، کدو (Cucurbita pepo)، توتون (Nicotiana tabacum) و لوبیاسبز (Phaseolusvulgaris) با بافر فسفات پتاسیم 1/. مولار و pH=7 مایه‌زنی شدند. دو نمونه W1 و ZMK4بعد از مایه‌زنی در گیاه خیار با ایجاد علائم بدشکلی منجر به انتقال CMV و ZYMV شدند. به منظور ردیابی ویروس‌های مورد نظر، استخراج آران‌ای کل از نمونه‌های مشکوک انجام و سنتز دی‌ان‌ای مکمل با استفاده از آغازگرهای تصادفی شش تایی انجام شد.پی‌سی‌آر با آغازگرهای اختصاصیCMV(f)/CMV(r) و ZYMV(f)/ZYMV(r) به ترتیب منجر به تکثیر قطعه‌ی مورد انتظار به طول bp867 مربوط به CMVو قطعه bp432 مربوط به ZYMVاز ژن پروتئین پوششی در 17 نمونه آلوده به این ویروس شد ولیCGMMV در هیچکدام از نمونه‌ها ردیابی نشد.به منظور بررسی صحت قطعات تکثیر یافته فرآورده پی-سی‌آر دو نمونه W1 و Z3 با قطعه‌ی bp867 به صورت مستقیم و قطعه bp432 مربوط به ایزوله B21پس از همسانه‌سازی برای تعیین توالی فرستاده شدندبدین منظور فرآورده پی‌سی‌آر به پلاسمید pTG19-T متصل و در باکتری E. coliDH5αکلون شد. باکتری‌های ترانسفورم شده با پلاسمید نوترکیب روی محیط کشت حاوی آمپی‌سیلین، IPTG و X-Gal انتخاب و غربال شده و پلاسمید نوترکیب حاوی قطعه پی‌سی‌آر، از باکتری‌های ترانسفورم شده استخراج گردید. پلاسمیدهای نوترکیب با استفاده از آغازگر T7 promotor تعیین توالی شد و توالی‌های CMV و ZYMV در بانک ژن ثبت گردید. هم‌ردیف‌سازی توالی CMV،98/8 % تشابه بین ایزوله‌های Z3 و W1 را نشان داد. 99-82% شباهت نوکلئوتیدی میان ایزوله‌های CMV استان کردستان با سایر ایزوله‌های گزارش شده دیده شد. ایزوله B21 دارای 99-91% شباهت نوکلئوتیدی با سایر ایزوله‌های ایران و جهانZYMVبود. آنالیز فیلوژنی براساس توالی ناحیه CP نشان داد که ایزوله‌های CMV با سایر ایزوله‌های ایرانی گزارش شده در یک گروه قرار می‌گیرد، در حالی که ایزوله B21 با ایزوله‌های صربستان، اتریش، مجارستان و اسلواکی در یک گروه قرار می‌گیرد |
| لینک فایل دیجیتالی : | https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/217b670c5c26a4b1d8ef5925e2660a2d |
| لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15230 |
| زبان مدرک : | فارسی |
ردیابی برخی ویروس‌های مهم در جالیزکاری‌های استان کردستان با روش RT-PCR [پایان‌نامه کارشناسی ارشد] (1393) / محمدی ، کژال، نویسنده 