| نوع مدرک: | برنامه‌ها و فایلهای کامپیوتری |
| سرشناسه | بهرام پور ، هاجره، نویسنده |
| عنوان : | ردیابی و بررسی تنوع ژنتیکی ویروس موزاییک هندوانه در کدوییان استان کردستان [پایان‌نامه کارشناسی ارشد] |
| تکرار نام مولف : | پدیدآور: هاجره بهرام پور استاد راهنما: محمد حاجی‌زاده استاد مشاور: جعفر عبدالله‌زاده |
| ناشر: | سنندح [ایران] : دانشگاه کردستان |
| سال نشر : | 1395 |
| یادداشت | رشته: مهندسی کشاورزی - بیماری‌شناسی گیاهی ـ بیماری‌شناسی گیاهی |
| شناسه افزوده : | حاجی‌زاده ، محمد، استاد راهنما عبدالله‌زاده ، جعفر، استاد مشاور |
| توصیفگرها | کدوییان ، کردستان ، نوترکیبی ، آرتی پی سی آر ، ویروس موزاییک هندوانه ، Kodoiyan, Kurdistan, recombination, RT-PCR, W.M.V |
| چکیده : | ویروس موزاییک هندوانه (Watermelon mosaic virus, WMV) یکی از گونه‌های مهم جنس Potyvirus از خانواده‌ی Potyviridae می‌باشد. به‌منظور ردیابی ویروس موزاییک هندوانه از جالیز‌کاری‌های استان کردستان، طی تابستان سال 1393، 46 نمونه برگی از میزبان‌های خیار، کدو، لوبیا سبز، هندوانه و بادمجان که دارای علائم مشکوک به این ویروس بودند، جمع‌آوری شد. ابتدا RNA کل مطابق روش بهینه‌شده روحانی و همکاران (1993) استخراج و سپس، با استفاده از آغازگرهای شش نوکلئوتیدی تصادفیcDNA مربوط به آن‌ها ساخته شد. درنهایت، محصولات cDNA به‌عنوان الگو برای تکثیر قسمتی از ژن پوشش پروتئینی ویروس موزائیک هندوانه در واکنش زنجیره‌ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهایWMVCP-f/WMV CP-r به‌کار گرفته شد. نتایج الکتروفورز روی ژل آگارز 2/1%، حاکی از تکثیر قطعه مورد انتظار حدود 657 جفت بازی در 22 نمونه (47 درصد) از نمونه‌های مورد مطالعه بود . در کل، بر اساس نتایج RT-PCR، 40%، 77%، 45% و 66% از نمونه‌های مورد مطالعه به ترتیب در میزبان‌های خیار، کدو، لوبیا سبز و هندوانه آلوده به ویروس موزاییک هندوانه بودند. در حالی‌که، این ویروس از میزبان بادمجان ردیابی نشد. قطعات تکثیر شده از ده نمونه‌ی (B21،B22 ، C49،C44 ، W5، W1، H7، Z3، Z6،Z17) پس از همسانه‌سازی، با استفاده از آغازگر T7 promoter تعیین توالی شدند و توالی‌های به‌دست آمده شامل 657 نوکلئوتید همراه با 89 ترادف انتخاب شده از بانک ژن مقایسه شدند. آنالیز فیلوژنتیکی و تخمین پارامتر‌های ژنتیکی با نرم‌افزارهای MEGA6 و DnaSP انجام شد. نتایج به‌دست آمده از درخت فیلوژنتیکی این جدایه‌ها را در 3 گروه (CL),Group1 (G2) ,Group2 (EM) Group3 قرار داد که جدایه‌های تعیین توالی شده در این تحقیق در گروه CL قرار گرفتند. محاسبه تنوع ژنتیکی (π) نشان داد که تنوع بین جدایه‌های استان کردستان 015/0 می‌باشد در حالی‌که، بین جدایه‌های ایران و جهان به ترتیب 0318/0 و 0435/0 تنوع وجود داشت. نسبت جانشینی نامترادف به جانشینی مترادف (dN/dS) در گروه‌های فیلوژنتیک کمتر از 1 به‌دست آمد که نشان‌دهنده نقش موثر انتخاب منفی در تنوع و تکامل این ویروس می‌باشد. بر اساس نتایج آنالیز نوترکیبی دو رخداد نوترکیبی در پنج جدایه از جمعیت ایران (Urmia, HOR.HA.1, AZ.MO.2, YAZ.MO.1 and YAZ.TA.1) مشاهده شد. به‌نظر می‌رسد که جهش نوکلئوتیدی، نوترکیبی و جریان ژنی نقش اساسی در تکامل این ویروس داشته است. بر اساس منابع موجود، این اولین گزارش از ردیابی ویروس موزاییک هندوانه در میزبان‌های لوبیا سبز و هندوانه و بررسی تنوع مولکولی در میزبان‌های خیار، لوبیا سبز، کدو و هندوانه در استان کردستان می‌باشد |
| لینک فایل دیجیتالی : | https://ganj.irandoc.ac.ir/#/articles/2333550cc95bffeab74496324abbbe2b |
| لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15735 |
| زبان مدرک : | فارسی |
ردیابی و بررسی تنوع ژنتیکی ویروس موزاییک هندوانه در کدوییان استان کردستان [پایان‌نامه کارشناسی ارشد] (1395) / بهرام پور ، هاجره، نویسنده 