| چکیده : | هدف از پژوهش حاضر، ارزیابی تنوع و تفاوت‌های ژنتیکی موجود در جمعیت اسب کردی در ایران با استفاده از نشانگرهای بین ریزماهواره‌ای بود. در این پژوهش از 99 راس اسب کرد متعلق به استان‌های کرمانشاه، کردستان، همدان و آذربایجان غربی در ارزیابی تنوع و تفاوت ژنتیکی درون جمعیتی استفاده شد. استخراج DNA به روش استخراج نمکی از نمونه‌های خون جمع‌آوری شده، انجام گرفت. از بین چهار آغازگر طراحی شده، دو آغازگرP2:)GA(9C و P1:)AG(9C که تعداد باند و پلی‌مورفیسم بیشتری را نشان داده بودند، برای اجرای این تحقیق انتخاب شدند. آغازگرهای مورد استفاده در مجموع 50 باند تولید کردند که 45 باند 90(%) آن پلی‌مورف بودند. دندروگرام روابط ژنتیکی درون جمعیت با استفاده از اطلاعات حاصل ماتریس باینری و به روش Xlstat ترسیم گردید. میانگین (انحراف معیار) تنوع ژنی با استفاده از دو آغازگر GA(9C(و AG(9C(برای کل نمونه‌های جمعیت 0/3646 0/1560بود. بررسی تشابه ژنتیکی درون جمعیت‌ها به دو روش استاندارد نئی)1972(و روش نااریب نئی)1978(نشان داد که بیشترین تشابه ژنتیکی بین گروه‌های درون جمعیت اسب کردی توسط آغازگر AG(9C(مشاهده شد. دندروگرام بدست‌آمده از آغازگر AG(9C(جمعیت را به چهار گروه، آغازگر GA(9C(جمعیت را به هفت گروه و ترکیب هر دو آغازگر جمعیت را به سه گروه تقسیم کرد. میانگین (انحراف معیار) شاخص شانن بدست آمده توسط آغازگر AG(9C(مقدار 0/5772 0/1832، 2546/0 5382/0(،GA(9C و برای ترکیب دو آغازگر 0/5311 0/2091 در جمعیت بود. مقادیر بدست‌آمده برای آلل مؤثر، درصد باند پلی‌مورف، تنوع ژنی نئی و شاخص شانون با آغازگر AG(9C(تنوع ژنتیکی بیشتری را نسبت به آغازگر GA(9C(در جمعیت اسب کردی نشان داد. واژگان کلیدی: تنوع ژنتیکی، نشانگرهای ISSR، اسب کردی
The main objective of our study was to evaluate the genetic diversity in Kurdish horse populations from Iran, using ISSR markers. 99 Kurdish horse blood samples are provided from Kermanshah, Kurdistan, Hamadan and West Azarbaijan provinces. The genomic DNA was extracted by Salting out method. Among designed primers, two primers P1:(AG)9C, P2: (GA)9C were selected based on number of amplified bands and extent of polymorphisms. PCR-ISSR produced a total of 50 amplified bands, from which 45 were polymorphic, revealing 90% polymorphism. Dendrogram of the genetic relationships within populations was generated using binary data matrix with the Xlstat software. The mean (SD) of gene diversity using two primer P1:(AG)9C, P2:(GA)9C were 0.3646 0.1560. Genetic similarity within population using standard genetic similarity index (Nei, 1972) and unbiased genetic similarity index (Nei, 1978) methods showed that the closest genetic similarity was among groups within the Kurdish horse population by primer (AG)9C. The dendrogram resulting from the primers (AG)9C, (GA)9C and two primers together divided population into four, seven and three groups, respectively. The mean (SD) of Shannon's index by primer (AG)9C, (GA)9C and combination of the two primers were 0.5772 0.1832, 0.5382 0.2546 and0.5311 0.2091 , respectively. The values obtained for the effective alleles, percentage of polymorphic bands, Nei gene diversity and Shannon index were higher compared to that of primer (GA)9C in the Kurdish horse population. Keywords: Genetic diversity, ISSR markers, Kurdish horse |
ارزیابی تنوع ژنتیکی در جمعیت اسب کردی با استفاده از نشانگر ISSR (پایان نامه) (1391) / بیگلری ، ناصر، نویسنده 