| چکیده : | چکیده ژنوم میتوکندری پستاندارن DNA دو رشته ای حلقوی بوده و حدود 16/5 کیلو باز طول دارد. این ژنوم در پستانداران از دو ناحیه کد کننده و غیر کد کننده)D-LOOP(تشکیل شده است و 37 ژن را کد می کند. سیتوکروم ها دسته ای از پروتئین های مرکب هستند که گروه پروستتیک آنها را حلقه پورفیرینی دارای آهن تشکیل می دهد. سیتوکروم ها در همه ی بافت ها یافت می شوند و به سه نوع اصلی ,a b و c تقسیم بندی می گردند. سیتوکروم b یکی از پروتئین های کمپلکس سیستم فسفریلاسیون اکسیداتیو است که فقط به وسیله ژنوم میتوکندری کد می شود. ژن سیتوکروم b اطلاعات فیلوژنی مفیدی را در سطوح مختلف تاکسنومی ارائه می کند. در این تحقیق پلی مورفیسم ژن سیتوکروم b در سه نژاد اسب کردی، عرب و ترکمن در چهار استان کردستان، همدان، کرمانشاه و آذربایجان غربی با استفاده از تکنیکPCR-RFLP بررسی شد. DNA استخراج شده از نمونه های خون این سه نژاد، پس از تکثیر به وسیله PCR، تحت تاثیر 5 آنزیم محدودالاثر EcoR ,Hae ,Taq ,Rsa(و BamH(قرار گرفتند. دو آلل،)590 A جفت بازی) و 484 ،)106 B جفت بازی) به وسیله آنزیم BamHI شناسایی شد. آلل A بیشترین فرانی)0/976(را در بین سه نژاد داشت. دو آلل مختلف دیگر با استفاده از آنزیم TaqI شناسایی شدند که آلل C بیشترین فراوانی)0/98(را در بین سه نژاد و آلل D با فراوانی)0/02(فقط در اسب های کردی مشاهده شد. سه آنزیم دیگر هیچ الگوی پلی مورفیسمی را نشان نداند. در چهار اسب از نژاد کردی با آنزیم TaqI، الگوی برشی جدید در ناحیه مورد تکثیر مشاهده گردید. نتایج تحقیق نشان داد که در ناحیه مورد بررسی تنوع بسیار کمی بین سه نژاد وجود دارد. کلمات کلیدی: اسب کردی، DNA میتوکندریایی، ژن سیتوکروم PCR-RFLP ،b
Abstract Genome of mammalian mitochondrial is a circular double helix DNA with approximalety 16.5 kbp length that is including coding and non-coding region)D-LOOP) and encodes 37 genes. Cytochromes are a group of combined proteins that their prostetic groups has porphyrin cycle with iron. Three types (a, b and c) of them are exist in all tissues. Cytochrome b is one of the proteins of complex of oxidative phosphorylation that only codes by mitochondrial DNA. Cytochrome b gene provides suitable phylogenic information in different levels of taxonomy. In this research, polymorphism of cytochrome b gene in Kurdish, Arab and Turkman horse breeds are investigated by PCR-RFLP technique. Samples are collected from Kurdistan, Kermanshah, Azarbayjanegharbi and Hamedan provinces in north west of Iran. DNA extracted from 209 blood samples of above breeds, amplified by PCR, and digested by 5 restriction enzymes (Taq , Rsa , BamH , EcoR and Hae). Digestion with BamH enzyme showed two alleles, A (590 bp) and B (106, 484 bp fregments). The A allele was most frequent (0.976) among 3 breeds. Two alleles C and D was observed by Taq enzyme digestion with 0.98 and 0.02 frequency, respectivly. Allele D was observed only in Kurdish breed. Other enzymes did not produce polymorphism. New Taq restriction site was observed only in Kurdish breed. Our results showed that there is low level of polymorphism in analyzed region of cytochrome b gene in studied horse breeds. Key words: Kurdish horse, mitochondria DNA, Cytochrome b gene, PCR-RFLP |
ارزیابی مولکولی ژن سیتوکروم b در DNA میتوکندری اسب کردی به روش PCR-RFLP (پایان نامه) (1389) / مرادی ، فرهاد، نویسنده 