واقع در:
![]()
ارزیابی تنوع ژنتیکی در جمعیت اسب کردی با استفاده از نشانگر ISSR (پایان نامه) (1391) / بیگلری ، ناصر، نویسنده
![]()
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه بیگلری ، ناصر، نویسنده عنوان : ارزیابی تنوع ژنتیکی در جمعیت اسب کردی با استفاده از نشانگر ISSR (پایان نامه) تکرار نام مولف : ناصر بیگلری ناشر: سنندج : کردستان سال نشر : 1391 ناشر دیگر : کشاورزی صفحه شمار: ه، 65 ص ویژگی : مصور، جدول، نمودار، عکس یادداشت زبان: فارسی کتابنامه،واژه نامه و نمایه کتابنامه: ص. 61-56 توصیفگرها نشانگرهایISSR اسب کردی تنوع ژنتیکی چکیده : هدف از پژوهش حاضر، ارزیابی تنوع و تفاوتهای ژنتیکی موجود در جمعیت اسب کردی در ایران با استفاده از نشانگرهای بین ریزماهوارهای بود. در این پژوهش از 99 راس اسب کرد متعلق به استانهای کرمانشاه، کردستان، همدان و آذربایجان غربی در ارزیابی تنوع و تفاوت ژنتیکی درون جمعیتی استفاده شد. استخراج DNA به روش استخراج نمکی از نمونههای خون جمعآوری شده، انجام گرفت. از بین چهار آغازگر طراحی شده، دو آغازگرP2:)GA(9C و P1:)AG(9C که تعداد باند و پلیمورفیسم بیشتری را نشان داده بودند، برای اجرای این تحقیق انتخاب شدند. آغازگرهای مورد استفاده در مجموع 50 باند تولید کردند که 45 باند 90(%) آن پلیمورف بودند. دندروگرام روابط ژنتیکی درون جمعیت با استفاده از اطلاعات حاصل ماتریس باینری و به روش Xlstat ترسیم گردید. میانگین (انحراف معیار) تنوع ژنی با استفاده از دو آغازگر GA(9C(و AG(9C(برای کل نمونههای جمعیت 0/3646 0/1560بود. بررسی تشابه ژنتیکی درون جمعیتها به دو روش استاندارد نئی)1972(و روش نااریب نئی)1978(نشان داد که بیشترین تشابه ژنتیکی بین گروههای درون جمعیت اسب کردی توسط آغازگر AG(9C(مشاهده شد. دندروگرام بدستآمده از آغازگر AG(9C(جمعیت را به چهار گروه، آغازگر GA(9C(جمعیت را به هفت گروه و ترکیب هر دو آغازگر جمعیت را به سه گروه تقسیم کرد. میانگین (انحراف معیار) شاخص شانن بدست آمده توسط آغازگر AG(9C(مقدار 0/5772 0/1832، 2546/0 5382/0(،GA(9C و برای ترکیب دو آغازگر 0/5311 0/2091 در جمعیت بود. مقادیر بدستآمده برای آلل مؤثر، درصد باند پلیمورف، تنوع ژنی نئی و شاخص شانون با آغازگر AG(9C(تنوع ژنتیکی بیشتری را نسبت به آغازگر GA(9C(در جمعیت اسب کردی نشان داد. واژگان کلیدی: تنوع ژنتیکی، نشانگرهای ISSR، اسب کردی
The main objective of our study was to evaluate the genetic diversity in Kurdish horse populations from Iran, using ISSR markers. 99 Kurdish horse blood samples are provided from Kermanshah, Kurdistan, Hamadan and West Azarbaijan provinces. The genomic DNA was extracted by Salting out method. Among designed primers, two primers P1:(AG)9C, P2: (GA)9C were selected based on number of amplified bands and extent of polymorphisms. PCR-ISSR produced a total of 50 amplified bands, from which 45 were polymorphic, revealing 90% polymorphism. Dendrogram of the genetic relationships within populations was generated using binary data matrix with the Xlstat software. The mean (SD) of gene diversity using two primer P1:(AG)9C, P2:(GA)9C were 0.3646 0.1560. Genetic similarity within population using standard genetic similarity index (Nei, 1972) and unbiased genetic similarity index (Nei, 1978) methods showed that the closest genetic similarity was among groups within the Kurdish horse population by primer (AG)9C. The dendrogram resulting from the primers (AG)9C, (GA)9C and two primers together divided population into four, seven and three groups, respectively. The mean (SD) of Shannon's index by primer (AG)9C, (GA)9C and combination of the two primers were 0.5772 0.1832, 0.5382 0.2546 and0.5311 0.2091 , respectively. The values obtained for the effective alleles, percentage of polymorphic bands, Nei gene diversity and Shannon index were higher compared to that of primer (GA)9C in the Kurdish horse population. Keywords: Genetic diversity, ISSR markers, Kurdish horseلینک فایل دیجیتالی : https://libapp.uok.ac.ir/faces/search/bibliographic/biblioFullView.jspx?_afPfm=1 [...] لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15866 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت ![]()
ارزیابی مولکولی ژن سیتوکروم b در DNA میتوکندری اسب کردی به روش PCR-RFLP (پایان نامه) (1389) / مرادی ، فرهاد، نویسنده
![]()
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه مرادی ، فرهاد، نویسنده عنوان : ارزیابی مولکولی ژن سیتوکروم b در DNA میتوکندری اسب کردی به روش PCR-RFLP (پایان نامه) تکرار نام مولف : فرهاد مرادی ناشر: سنندج : کردستان سال نشر : 1389 ناشر دیگر : کشاورزی صفحه شمار: ط، 64 ص ویژگی : مصور،جدول، عکس + یک لوح فشرده یادداشت زبان: فارسی کتابنامه،واژه نامه و نمایه کتابنامه: ص. 55-51 توصیفگرها PCR-RFLP ژن سیتوکروم b DNA میتوکندریایی اسب کردی چکیده : چکیده ژنوم میتوکندری پستاندارن DNA دو رشته ای حلقوی بوده و حدود 16/5 کیلو باز طول دارد. این ژنوم در پستانداران از دو ناحیه کد کننده و غیر کد کننده)D-LOOP(تشکیل شده است و 37 ژن را کد می کند. سیتوکروم ها دسته ای از پروتئین های مرکب هستند که گروه پروستتیک آنها را حلقه پورفیرینی دارای آهن تشکیل می دهد. سیتوکروم ها در همه ی بافت ها یافت می شوند و به سه نوع اصلی ,a b و c تقسیم بندی می گردند. سیتوکروم b یکی از پروتئین های کمپلکس سیستم فسفریلاسیون اکسیداتیو است که فقط به وسیله ژنوم میتوکندری کد می شود. ژن سیتوکروم b اطلاعات فیلوژنی مفیدی را در سطوح مختلف تاکسنومی ارائه می کند. در این تحقیق پلی مورفیسم ژن سیتوکروم b در سه نژاد اسب کردی، عرب و ترکمن در چهار استان کردستان، همدان، کرمانشاه و آذربایجان غربی با استفاده از تکنیکPCR-RFLP بررسی شد. DNA استخراج شده از نمونه های خون این سه نژاد، پس از تکثیر به وسیله PCR، تحت تاثیر 5 آنزیم محدودالاثر EcoR ,Hae ,Taq ,Rsa(و BamH(قرار گرفتند. دو آلل،)590 A جفت بازی) و 484 ،)106 B جفت بازی) به وسیله آنزیم BamHI شناسایی شد. آلل A بیشترین فرانی)0/976(را در بین سه نژاد داشت. دو آلل مختلف دیگر با استفاده از آنزیم TaqI شناسایی شدند که آلل C بیشترین فراوانی)0/98(را در بین سه نژاد و آلل D با فراوانی)0/02(فقط در اسب های کردی مشاهده شد. سه آنزیم دیگر هیچ الگوی پلی مورفیسمی را نشان نداند. در چهار اسب از نژاد کردی با آنزیم TaqI، الگوی برشی جدید در ناحیه مورد تکثیر مشاهده گردید. نتایج تحقیق نشان داد که در ناحیه مورد بررسی تنوع بسیار کمی بین سه نژاد وجود دارد. کلمات کلیدی: اسب کردی، DNA میتوکندریایی، ژن سیتوکروم PCR-RFLP ،b
Abstract Genome of mammalian mitochondrial is a circular double helix DNA with approximalety 16.5 kbp length that is including coding and non-coding region)D-LOOP) and encodes 37 genes. Cytochromes are a group of combined proteins that their prostetic groups has porphyrin cycle with iron. Three types (a, b and c) of them are exist in all tissues. Cytochrome b is one of the proteins of complex of oxidative phosphorylation that only codes by mitochondrial DNA. Cytochrome b gene provides suitable phylogenic information in different levels of taxonomy. In this research, polymorphism of cytochrome b gene in Kurdish, Arab and Turkman horse breeds are investigated by PCR-RFLP technique. Samples are collected from Kurdistan, Kermanshah, Azarbayjanegharbi and Hamedan provinces in north west of Iran. DNA extracted from 209 blood samples of above breeds, amplified by PCR, and digested by 5 restriction enzymes (Taq , Rsa , BamH , EcoR and Hae). Digestion with BamH enzyme showed two alleles, A (590 bp) and B (106, 484 bp fregments). The A allele was most frequent (0.976) among 3 breeds. Two alleles C and D was observed by Taq enzyme digestion with 0.98 and 0.02 frequency, respectivly. Allele D was observed only in Kurdish breed. Other enzymes did not produce polymorphism. New Taq restriction site was observed only in Kurdish breed. Our results showed that there is low level of polymorphism in analyzed region of cytochrome b gene in studied horse breeds. Key words: Kurdish horse, mitochondria DNA, Cytochrome b gene, PCR-RFLPلینک فایل دیجیتالی : https://libapp.uok.ac.ir/faces/search/bibliographic/biblioFullView.jspx?_afPfm=1 [...] لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15868 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت ![]()
ارزیابی تنوع ژنتیکی اسب کردی با استفاده از نشانگرهای ریز ماهواره ای (پایان نامه) (1389) / جوان میری ، اقبال، نویسنده
![]()
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه جوان میری ، اقبال، نویسنده عنوان : ارزیابی تنوع ژنتیکی اسب کردی با استفاده از نشانگرهای ریز ماهواره ای (پایان نامه) تکرار نام مولف : اقبال جوان میری ناشر: سنندج : کردستان سال نشر : 1389 ناشر دیگر : کشاورزی صفحه شمار: ه ، 64 ص ویژگی : مصور، جدول، عکس (رنگی) + یک لوح فشرده یادداشت زبان: فارسی کتابنامه،واژه نامه و نمایه کتابنامه: ص. 61 - 56 توصیفگرها چند شکلی هتروزیگوسیتی تنوع ژنتیکی نشانگرهای ریز ماهواره اسب کرد چکیده : چکیده در مطالعه حاضر تنوع ژنتیکی درون سه جمعیت اسب کرد (کردی، کلهر و افشاری) و بین سه نژاد (عرب، کرد و عرب- کرد) با استفاده از دو جفت آغازگر ریز ماهوارهای NVHEQ70(و)HMS7 مورد بررسی قرار گرفتند. استخراج DNA به روش استخراج نمکی انجام گرفت. تمامی جایگاه هها در همه جمعیتها کاملا چند شکل بودند. تمام جایگاهها در سطح) Abstract In the present study genetic variation within three Kurdish horse populations (Kurdi, Kalhor and Afshari) and between three Iranian horse breeds (Arabian, Kurdish and Arab-Kurd) was assessed using two microsatellite markers (NVHEQ70 and HMS7). All loci were polymorphic in all populations. All locus-population combinations were at Hardy-Weinberg nonequilibrium (p<0.05). The lowest genetic distance (0.073) was obtained between Kurdish and Arab-Kurd and the highest genetic distance observed (0.243) between Kurdish and Arabian. Within Kurdish population, the lowest and the highest genetic distance were observed between Afshari and Kalhor and between Kurdi and Afshari, respectively. The dandrogram based on genetic distance was drown using unweighted pair group method using an arithmetic average (UPGMA). The Kurd and Arab-Kurd were located together at one cluster and Arabian at another. In Kurdish population, Afshari and Kalhor were located at one cluster and Kurdi at another.The average expected heterozygosity for each breeds ranged from 0.227 to 0.844 for Turkaman and Kurd, respectively. In Kurdish population, the small difrences expected heterozygosity obtained between highest and lowest. All markers have relatively high polymorphic information content (PIC) value (> 0.6). One the base of finding of this research, we can conclude that microsatellite variation could be an useful tool for screening of biodiversity domestic animal. Keyword: Kurdish horse, Microsatellites markers, Genetic variation, Heterozygosity, Polymorphism لینک فایل دیجیتالی : https://libapp.uok.ac.ir/faces/search/bibliographic/biblioFullView.jspx?_afPfm=j [...] لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=15910 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت فاقد شماره ثبت